Teplá Vltava na území NP Šumava mezi obcí Lenora a přehradou Lipno protéká lokalitou Vltavský luh, která je přírodní památkou. V současné době jsou zde vymezeny 1. a 2. zóny národního parku. Jedná se o součást SCI Šumava (CZ0314024) a SPA Šumava (CZ0311041).
Celý text